有時候黴漿菌感染嚴重時，可在肺部Ｘ光片看到肺炎現象，但卻沒有像一般細菌性肺炎引起的胸痛或是高燒。
黴漿菌氣管肺炎會引起如此長期咳嗽的主因是黴漿菌形狀細長如梭狀，剛好可卡在肺部呼吸道上皮的絨毛與纖毛之間，而且會分泌毒性的細胞介質，讓纖毛擺動排痰的功能失常，所以患者會出現濃痰不易排出，而引起慢性咳嗽。
治療上，普通的感冒化痰、止咳藥物只能改善少許症狀，效果不大。針對性的治療首選是紅黴素類的抗生素。一般療程在一周至兩周內即可治愈。預防上，因黴漿菌主要是透過飛沫傳染，所以容易在幼稚園及家庭成員間相互傳染。目前並沒有疫苗預防，感染之後也無法終生免疫，所以建議兒童若有嚴重咳嗽就要盡快求醫及留在家休息，適當的戴口罩也是有幫助的。
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